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“新冠”肺炎疫情發酵,加速了醫療信息化的發展;病毒形態分析、疫苗研發也從科學研究領域話題演變為大眾關心的民生話題,生物基因數據價值愈加凸顯。同時,為提高診斷效率,國家允許符合條件的第三方機構開展核酸檢測,獨立實驗室的重要性又一次顯現。

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日前,全球生命科學領域首個綜合性的大科學裝置——國家蛋白質科學研究(上海)設施,開通了支持新冠肺炎病毒相關研究的快捷綠色通道。

曙光通過為國家蛋白質科學研究(上海)設施搭建的“醫學大數據設施-信息系統基礎平臺”,為其研究新冠肺炎病毒相關蛋白的晶體結構、核磁和冷凍電鏡數據的采集與分析以及病毒形態學檢測等項目提供了支撐;全力支持與新冠肺炎病毒相關的蛋白質結構與致病機理研究、快速檢測技術產品研發以及抗病毒藥物和疫苗研發等工作。

解碼生物數據應用“新要求”

生物醫學大數據基礎設施深刻體現前沿信息技術與現代生命科學的交叉。除了病毒形態研究以外,我們也看到了精準醫療、個性化醫療的未來發展趨勢。

由曙光公司為國家蛋白質科學研究(上海)搭建的“醫學大數據設施-信息系統基礎平臺”,以患者生理生化指標,器官影像檢查、家族遺傳背景等多維度的數據為基礎,結合基因組測序、蛋白質組學和代謝組學等各種先進組學檢測等技術,通過生物信息學手段進行綜合數據分析和挖掘,提供與疾病診斷和治療相關的遺傳和臨床信息。形成特征數據后,再通過機器深度學習和人工智能等方法,實現真正意義上的精準分析、輔助診斷和個性化醫療。

多年積累,應對生物數據“海量”與“多變”

在對海量生物數據中的深刻規律進行研究時,曙光發現,必須保證數據的3特征,即數據量大,處理數據效率高,數據源要有多變性。借助這些特點,才可以實現大數據的分析和預測。

基因研究產生的數據以每12-18個月10倍的速度快速增長。針對海量數據,曙光ParaStor分布式存儲系統可通過性能與容量的線性增長,滿足存儲系統對數據處理能力和擴展性的要求。通過系列先進技術,曙光ParaStor分布式存儲系統消除擴展存儲架構的性能局限性,解決生物基因應用中對數據處理效率和數據多變性的需求。

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抓住“新趨勢”,持續深耕生物基因領域

生命科學對于疫情的幫助,不僅限于分子生物學診斷以及毒株鑒定,疫苗生產,還包括預防醫學,流行病學等。因此,疫情過后,分子診斷、基因測序、第三方醫學實驗室也將逆勢成長,生物基因與信息技術的融合也將更緊密。

多年來,曙光公司深耕生物基因領域,為上海瑞金醫院、北京天壇醫院、北京基因組研究所、上海生命科學研究院、上海市疾病預防控制中心等單位提供產品與解決方案,支持醫療影像、基因測序、冷凍電鏡、藥品研發等應用的穩定運行。未來,曙光也將不斷提供創新的技術與產品,為生物基因技術的快速發展發揮重要作用。

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