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清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院


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清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院成立于 2001年10月25日，當(dāng)前，世界范圍內(nèi)普遍認(rèn)識到生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)是當(dāng)今世界科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域最活躍、最有希望取得關(guān)鍵性突破的學(xué)科之一，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院正是基于此而創(chuàng)立的。醫(yī)學(xué)院是清華大學(xué)為順應(yīng)國家發(fā)展需要及世界高等教育和科學(xué)技術(shù)發(fā)展的趨勢，為向世界一流大學(xué)的目標(biāo)奮進(jìn)邁出的極為重要的一步。為了使清華大學(xué)在 2011 年前能躋身于國際一流大學(xué)之林，清華大學(xué)校領(lǐng)導(dǎo)已明確提出“要爭取在信息、納米及生命科學(xué)上有所突破”這一戰(zhàn)略目標(biāo)。


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由于科研中需要處理的數(shù)據(jù)量大，需要借助與高性能集群系統(tǒng)才能完成，曙光公司為其配備了雙路節(jié)點和八路大內(nèi)存節(jié)點，提供整體峰值6.6萬億次每秒，并針對用戶的應(yīng)用程序，曙光公司專門做了應(yīng)用優(yōu)化，使其使用效率增加了10%-28%。系統(tǒng)建成后主要為以下兩方面應(yīng)用提供服務(wù)：

掃描電鏡數(shù)據(jù)處理：掃描電鏡是生命科學(xué)研究中必不可少的儀器設(shè)備，主要通過用極細(xì)的電子束在樣品表面掃描，獲得原始數(shù)據(jù)(RAW DATA)然后通過軟件進(jìn)行提純和分析，將產(chǎn)生的二次電子用特制的探測器收集，形成電信號運送到顯像管，在熒光屏上顯示物體 (細(xì)胞、組織)表面的立體構(gòu)像，攝制成照片，獲得人類認(rèn)知范疇之內(nèi)的信息。其計算軟件主要為spider和eman。

分子動力學(xué)模擬：分子動力學(xué)是一套分子模擬方法，該方法在定義原子之間作用勢的基礎(chǔ)上，依靠牛頓力學(xué)來模擬分子體系的運動，從而探索體系的動力學(xué)特性和熱力學(xué)特性，對于揭示生命的本質(zhì)、研究生命體的活動有著非常重要的意義。主要應(yīng)用軟件有NAMD等。


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